Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nhlrc4Q3UP44 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nhlrc4Q3UP44 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nhlrc4Q3UP44 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nhlrc4Q3UP44 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nhlrc4Q3UP44 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms