Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sf3b2Q3UJB0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sf3b2Q3UJB0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sf3b2Q3UJB0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sf3b2Q3UJB0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Sf3b2Q3UJB0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms