Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx27Q3UHD6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx27Q3UHD6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx27Q3UHD6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Snx27Q3UHD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx27Q3UHD6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms