Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph3aQ3UFY4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph3aQ3UFY4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph3aQ3UFY4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rsph3aQ3UFY4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rsph3aQ3UFY4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms