Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Garem1Q3UFT3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Garem1Q3UFT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Garem1Q3UFT3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Garem1Q3UFT3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms