Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LcorlQ3U285 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LcorlQ3U285 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LcorlQ3U285 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LcorlQ3U285 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LcorlQ3U285 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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