Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1V8

Map3k9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k9Q3U1V8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Map3k9Q3U1V8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k9Q3U1V8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Map3k9Q3U1V8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Map3k9Q3U1V8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Map3k9Q3U1V8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Map3k9Q3U1V8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms