Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem35bQ3U0Y2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem35bQ3U0Y2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms