Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a5Q3TYU2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a5Q3TYU2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a5Q3TYU2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp13a5Q3TYU2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms