Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLH4

Prrc2c, Protein PRRC2C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2cQ3TLH4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prrc2cQ3TLH4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prrc2cQ3TLH4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prrc2cQ3TLH4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prrc2cQ3TLH4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms