Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDN2

Faf2, FAS-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf2Q3TDN2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Faf2Q3TDN2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Faf2Q3TDN2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Faf2Q3TDN2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Faf2Q3TDN2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Faf2Q3TDN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms