Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZufspQ3T9Z9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZufspQ3T9Z9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZufspQ3T9Z9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZufspQ3T9Z9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZufspQ3T9Z9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms