Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,91□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,9□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12,9□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12,9□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC12,9□□□□□ -0,34
Ush2AQ2QI47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,9□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC12,9□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,89□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC12,89□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,89□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,89□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12,89□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12,88□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,88□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,88□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12,87□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,86□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,85□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12,84□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12,83□□□□□ -0,35
Ush2AQ2QI47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,83□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12,82□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,82□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC12,82□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,81□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12,81□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12,81□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12,8□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,79□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12,79□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC12,79□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12,79□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,79□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,78□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12,77□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,77□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC12,77□□□□□ -0,36
Ush2AQ2QI47 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,77□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Ush2AQ2QI47 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12,76□□□□□ -0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,6 ms