Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm1123Q1RME4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm1123Q1RME4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm1123Q1RME4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm1123Q1RME4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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