Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fgfbp3Q1HCM0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgfbp3Q1HCM0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgfbp3Q1HCM0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms