Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Myo3bQ1EG27 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Myo3bQ1EG27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Myo3bQ1EG27 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Myo3bQ1EG27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Myo3bQ1EG27 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Myo3bQ1EG27 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.9 ms