Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itgb8Q0VBD0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb8Q0VBD0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb8Q0VBD0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itgb8Q0VBD0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms