Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prelid2Q0VBB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prelid2Q0VBB0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prelid2Q0VBB0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prelid2Q0VBB0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms