Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5bQ0V8T8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5bQ0V8T8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5bQ0V8T8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5bQ0V8T8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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