Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab42Q0PD08 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rab42Q0PD08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rab42Q0PD08 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rab42Q0PD08 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms