Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Kndc1Q0KK55 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Kndc1Q0KK55 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Kndc1Q0KK55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kndc1Q0KK55 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kndc1Q0KK55 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kndc1Q0KK55 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kndc1Q0KK55 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.7 ms