Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc7a1Q09143 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc7a1Q09143 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc7a1Q09143 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc7a1Q09143 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc7a1Q09143 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc7a1Q09143 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc7a1Q09143 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc7a1Q09143 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc7a1Q09143 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms