Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tfdp1Q08639 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfdp1Q08639 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tfdp1Q08639 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfdp1Q08639 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfdp1Q08639 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfdp1Q08639 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfdp1Q08639 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms