Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata4Q08369 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata4Q08369 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata4Q08369 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata4Q08369 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms