Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Fmn1Q05860 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Fmn1Q05860 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
Fmn1Q05860 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Fmn1Q05860 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Fmn1Q05860 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Fmn1Q05860 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Fmn1Q05860 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fmn1Q05860 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Fmn1Q05860 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms