Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcn1Q05186 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcn1Q05186 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcn1Q05186 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcn1Q05186 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcn1Q05186 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn1Q05186 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn1Q05186 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcn1Q05186 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcn1Q05186 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms