Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcad1Q04692 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcad1Q04692 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smarcad1Q04692 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smarcad1Q04692 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smarcad1Q04692 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms