Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcr5Q04683 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cxcr5Q04683 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cxcr5Q04683 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cxcr5Q04683 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cxcr5Q04683 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms