Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Thbs2Q03350 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thbs2Q03350 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thbs2Q03350 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thbs2Q03350 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms