Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col6a2Q02788 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col6a2Q02788 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col6a2Q02788 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col6a2Q02788 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms