Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax5Q02650 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax5Q02650 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax5Q02650 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pax5Q02650 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms