Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nhlh1Q02576 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nhlh1Q02576 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nhlh1Q02576 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nhlh1Q02576 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nhlh1Q02576 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms