Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ascl1Q02067 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ascl1Q02067 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ascl1Q02067 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ascl1Q02067 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms