Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VcpQ01853 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VcpQ01853 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VcpQ01853 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VcpQ01853 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VcpQ01853 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VcpQ01853 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VcpQ01853 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcpQ01853 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VcpQ01853 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms