Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hoxd1Q01822 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxd1Q01822 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd1Q01822 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd1Q01822 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms