Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pde4dQ01063 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pde4dQ01063 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pde4dQ01063 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pde4dQ01063 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pde4dQ01063 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pde4dQ01063 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms