Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Gjb2Q00977 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gjb2Q00977 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gjb2Q00977 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gjb2Q00977 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gjb2Q00977 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gjb2Q00977 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms