Protein–RNA interactions for Protein: Q00322

Cebpd, CCAAT/enhancer-binding protein delta, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpdQ00322 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CebpdQ00322 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CebpdQ00322 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CebpdQ00322 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CebpdQ00322 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms