Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VldlrP98156 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VldlrP98156 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VldlrP98156 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VldlrP98156 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VldlrP98156 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VldlrP98156 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VldlrP98156 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VldlrP98156 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VldlrP98156 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VldlrP98156 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VldlrP98156 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VldlrP98156 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VldlrP98156 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VldlrP98156 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VldlrP98156 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VldlrP98156 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VldlrP98156 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VldlrP98156 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VldlrP98156 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VldlrP98156 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VldlrP98156 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VldlrP98156 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VldlrP98156 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VldlrP98156 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VldlrP98156 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms