Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Bmp1P98063 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Bmp1P98063 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Bmp1P98063 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bmp1P98063 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bmp1P98063 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms