Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Crmp1P97427 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Crmp1P97427 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Crmp1P97427 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Crmp1P97427 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms