Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SmsP97355 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmsP97355 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmsP97355 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmsP97355 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmsP97355 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SmsP97355 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SmsP97355 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SmsP97355 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmsP97355 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SmsP97355 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmsP97355 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SmsP97355 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmsP97355 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SmsP97355 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SmsP97355 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SmsP97355 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmsP97355 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SmsP97355 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmsP97355 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmsP97355 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SmsP97355 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SmsP97355 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SmsP97355 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmsP97355 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmsP97355 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmsP97355 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmsP97355 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SmsP97355 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmsP97355 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmsP97355 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SmsP97355 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SmsP97355 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmsP97355 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmsP97355 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmsP97355 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SmsP97355 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SmsP97355 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SmsP97355 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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SmsP97355 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SmsP97355 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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SmsP97355 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmsP97355 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SmsP97355 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SmsP97355 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmsP97355 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmsP97355 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SmsP97355 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmsP97355 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmsP97355 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmsP97355 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmsP97355 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SmsP97355 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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SmsP97355 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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SmsP97355 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmsP97355 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SmsP97355 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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SmsP97355 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmsP97355 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmsP97355 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SmsP97355 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmsP97355 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmsP97355 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SmsP97355 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmsP97355 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SmsP97355 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SmsP97355 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SmsP97355 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmsP97355 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SmsP97355 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms