Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem170bP86050 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tmem170bP86050 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem170bP86050 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms