Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TnikP83510 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TnikP83510 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TnikP83510 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TnikP83510 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TnikP83510 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TnikP83510 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TnikP83510 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TnikP83510 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TnikP83510 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TnikP83510 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TnikP83510 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TnikP83510 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TnikP83510 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TnikP83510 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TnikP83510 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TnikP83510 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TnikP83510 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TnikP83510 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
TnikP83510 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TnikP83510 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TnikP83510 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TnikP83510 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TnikP83510 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TnikP83510 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TnikP83510 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TnikP83510 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TnikP83510 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TnikP83510 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TnikP83510 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TnikP83510 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TnikP83510 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TnikP83510 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TnikP83510 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TnikP83510 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TnikP83510 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TnikP83510 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TnikP83510 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TnikP83510 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TnikP83510 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TnikP83510 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TnikP83510 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TnikP83510 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TnikP83510 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TnikP83510 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TnikP83510 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TnikP83510 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TnikP83510 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TnikP83510 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TnikP83510 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TnikP83510 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TnikP83510 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TnikP83510 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TnikP83510 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TnikP83510 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TnikP83510 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TnikP83510 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TnikP83510 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TnikP83510 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TnikP83510 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TnikP83510 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TnikP83510 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TnikP83510 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TnikP83510 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TnikP83510 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TnikP83510 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TnikP83510 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TnikP83510 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TnikP83510 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TnikP83510 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TnikP83510 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TnikP83510 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TnikP83510 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TnikP83510 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TnikP83510 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TnikP83510 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TnikP83510 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TnikP83510 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TnikP83510 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms