Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nucb2P81117 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nucb2P81117 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nucb2P81117 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nucb2P81117 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nucb2P81117 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms