Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf7P70434 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf7P70434 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf7P70434 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf7P70434 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf7P70434 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf7P70434 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf7P70434 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf7P70434 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Irf7P70434 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf7P70434 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Irf7P70434 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf7P70434 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Irf7P70434 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf7P70434 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Irf7P70434 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf7P70434 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.6 ms