Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tp53bp1P70399 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tp53bp1P70399 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tp53bp1P70399 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tp53bp1P70399 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tp53bp1P70399 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tp53bp1P70399 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms