Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SeboxP70368 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SeboxP70368 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SeboxP70368 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SeboxP70368 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SeboxP70368 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms