Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cux2P70298 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cux2P70298 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Cux2P70298 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cux2P70298 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Cux2P70298 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux2P70298 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux2P70298 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux2P70298 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Cux2P70298 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cux2P70298 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Cux2P70298 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux2P70298 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux2P70298 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux2P70298 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Cux2P70298 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Cux2P70298 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Cux2P70298 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Cux2P70298 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Cux2P70298 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Cux2P70298 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cux2P70298 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms