Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vamp7P70280 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vamp7P70280 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vamp7P70280 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vamp7P70280 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vamp7P70280 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms